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FPGA Implementation of the FM-Index String Matching algorithm

Name: FPGA Implementation of the FM-Index String Matching algorithm
Brand: Scholars' Press
SKU: 06936667
Price: 60.46 EUR
Availability: InStock
Author: Edward Bryann Fernandez
ISBN: 9783639702781

Edward Bryann Fernandez

Sprache

Englisch

Buch Broschur

Libristo-Code: 06936667

Verlag Scholars' Press, November 2013

This book discusses the research processes of developing a hardware implementation of a string match... Vollständige Beschreibung

Libristo-Code: 06936667

146 b

60.46 €

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This book discusses the research processes of developing a hardware implementation of a string matching algorithm. The first phase of the research is qualifying the appropriate algorithm for the application of DNA sequence matching. The second phase is re-inventing the algorithm to make it suitable for a hardware implementation. The third phase is implementing the chosen algorithm using FPGAs. The last phase is measuring performance using real data sets for comparison to other known tools. Our implementation shows a real time speedup up of up to 70x against BOWTIE, a known tool used in sequence matching.

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Informationen zum Buch

Vollständiger Name FPGA Implementation of the FM-Index String Matching algorithm

Autor Edward Bryann Fernandez

Sprache

Englisch

Einband Buch - Broschur

Datum der Veröffentlichung 2013

Anzahl der Seiten 140

EAN 9783639702781

ISBN 3639702786

Libristo-Code 06936667

Verlag Scholars' Press

Gewicht 213

Abmessungen 152 x 229 x 8

Kategorie

Mathematik und Naturwissenschaften > Biologie, Biowissenschaften > Biowissenschaften, allgemein > Genetik (nicht-medizinisch)

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