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La biologie reconnaît deux entités dont l'existence semble une donnée immédiate de la perception et non une élaboration théorique ou le résultat d'une démarche expérimentale. Ces entités premières sont l'espèce et l'individu, dont la biologie cherche à expliquer la genèse et le fonctionnement. D'une part, la théorie de la sélection naturelle explique l'évolution des espèces (phylogenèse), d'autre part, celle du programme génétique explique le développement des organismes individuels (ontogenèse). Pour l'auteur, cette manière de scinder la biologie n'est plus tenable au regard des données expérimentales acquises récemment. Et il propose une nouvelle théorie dite de l'ontophylogenèse qui, au contraire, unifie la biologie. Dans son cadre, l'évolution des espèces et le développement embryonnaire résultent d'un seul processus de sélection naturelle étendue.
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